Народився у Квебеку в родині лікаря. Закінчив університет Макгілла, в 1936-1938 роках відвідував курси при психіатричній клініці в Єлі, потім навчався в Нью-Йоркському (1941-1943) та Сан-Франциському (1947-1956) інститутах психоаналізу. 1943 року прийняв американське громадянство. З 1951 по 1954 рік служив в армії США, потім працював у низці психіатричних клінік, з початку 60-х став вести семінари з групової терапії.
За підсумками цих семінарів згодом написав книгу, яка стала міжнародним бестселером, - "Ігри, в які грають люди". Ерік Берн був членом Американської асоціації психіатрів та Індійського психіатричного товариства; крім того, він започаткував Міжнародну асоціацію трансперсонального аналізу.